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德國慕尼黑大學針對顯微虛擬縫紉成像研究解讀

來自:

慕尼黑社會

2019/10/10 10:29:59發布

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  新穎的顯微鏡方法提供了完整器官的極其詳細的圖像-但也提供了大量難以處理的數據。BigStitcher軟件可以簡單而精確地從許多單獨的圖片中創建一個大的整體。

德國慕尼黑大學針對顯微虛擬縫紉成像研究解讀

  圖像具有迷人的細節,它們顯示細胞中最小的結構,可以對整個器官進行成像。使用化學方法,現在可以使較大的生物樣品透明,可以使用新方法(例如所謂的光片顯微鏡)進行篩選。

  但看細節,在整個器官或生物,如單個神經元在一個完整的小鼠大腦的連接的情況下高分辨率亞細胞結構,許多幀都被組合以形成整體的畫面,那被稱為拼接的過程。原始數據通常達到幾TB(TB),相當于數百萬張普通照片。這對拼接軟件提出了很高的要求,拼接軟件旨在自動無縫地將各個圖像連接在一起。

  HeinrichLeonhardt教授(LMU生物學系)和Ing。博士的科學家。斯蒂芬Preibisch(德爾布呂克分子醫學中心,柏林)現在有阿什伯恩HHMI的珍利亞農場研究園區的合作者一起,開發BigStitcherVA(USA)軟件包-顯著先進技術進行重建。

  通過他們的計算機程序,研究人員為高維顯微鏡圖像數據的管理提供了多種功能:BigStitcher可以有效地安排任意數量的三維單幅圖像。此外,該軟件還允許校正各種光學誤差,例如色差或局部幾何失真。

  該開發的主要目標是易用性和在傳統硬件上運行的能力。大衛霍爾說AGLeonhardt的第一作者和博士候選人:"只有少數工作組和顯微鏡設施聘請經過專門培訓的圖像分析師。使用我們的軟件,我們希望在沒有計算機科學深入知識的情況下為用戶提供如此大的圖像數據集。

  BigStitcher在其圖形用戶界面(GUI)中提供結果的實時預覽,從而可以快速識別各個處理步驟中的問題,而無需繁瑣地重復整個過程。通過巧妙地管理多分辨率金字塔中的數據,類似于谷歌地圖,我們還可以在普通計算機上拼接如此大的圖像數據。"科學家們開發了BigStitcher作為流行的圖像處理程序ImageJ的插件。

  德國歐盟藍卡

  法案依據:德國于2009年頒布的一項旨在吸引全球范圍內的高端技術人才來歐盟區工作和移居的法律條款,以求彌補歐盟內部巨大的高技術人才缺口。(居留法第19a條:http://www.gesetze-im-internet.de/englisch_aufenthg/englisch_aufenthg.html#p0364)。

  歐盟藍卡簽證是目前取得德國永久居留權的最快方式,持歐盟藍卡為雇主工作33個月后并累計繳滿33個月的社保,同時可以證明此時具有收入來源的情況下允許申請德國永久居留許可。如若申請者具備德語B1程度,并在期間繳滿相應保險,亦可能于21個月后申請;特殊人才通過外管局評估,入境后即可獲得德國居留權。持有人僅需每半年入境一次即可保留簽證。藍卡持有人的家屬可取得家庭團聚簽證,可以在德國自由擇業。全家可享受德國公民一切福利待遇政策。

  法案規定申請條件:

  1.德國官方教育機構認可的本科以上學歷和學位證明;

  2.具備一份高薪年收入總額不低于52000歐元(稀缺人才可適當放寬);

  3.或五年以上相關行業工作經驗;

  4.擁有德國雇主出具合法的勞動合同,并且薪酬符合申請德國歐盟藍卡的標準;

  5.具備英語或德語水平可以滿足德國當地工作及生活能力為佳

  聲明:本文圖片來源于網絡

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